根河是大興安嶺林區(qū)重要組成部分,森林資源極其豐富。根河市森林面積為184萬(wàn)公頃,占全國(guó)的1.36%,占全區(qū)的11.2%,森林覆蓋率91.7%。全市活立木蓄積量1.87億立方米,占全國(guó)的1.3%,占全區(qū)的14.5%。興安落葉松是根河市最主要、分布最廣的建群樹(shù)種,有114萬(wàn)公頃,占全市森林面積的76%,白樺與興安落葉松組成混交林29萬(wàn)公頃,占全市森林面積的19.3%。還有樟子松、山楊、楊樹(shù)、柳樹(shù)等樹(shù)種。最北部原始森林中生長(zhǎng)有61株西伯利亞紅松被鄂溫克獵民稱(chēng)為“神樹(shù)”。根河市草場(chǎng)有常見(jiàn)植物149種，分屬38科、118屬。多數(shù)草場(chǎng)植物種類(lèi)豐富，每平方米25～30種，草群蓋度一般為70～100%；草層高40～95厘米，蓋度一般為70～95%。優(yōu)質(zhì)牧草主要有豆科與禾本科的羊草、貝加爾針茅、野豌豆、野火球、羊茅、日陰菅、萎陵菜、唐松草、胡枝子、地榆等。2019年，根河市地方草原行政管理部門(mén)管理的草原權(quán)限范圍內(nèi)，開(kāi)展草情監(jiān)測(cè)，春季干旱，林間草場(chǎng)發(fā)生輕度草原鼠、蟲(chóng)害，對(duì)草原生態(tài)基本沒(méi)有影響，經(jīng)檢查沒(méi)有發(fā)現(xiàn)非法采挖野生植物及非法開(kāi)墾草原案件。

根河市野生動(dòng)物在地理區(qū)劃中為古北界東北區(qū)大興嶺亞區(qū)，動(dòng)物以林棲型為主。大型獸類(lèi)有馴鹿、馬鹿、棕熊、黑熊狍、野豬等。小型動(dòng)物中的黃鼬、香鼠、灰鼠、艾鼬等數(shù)量較多,鳥(niǎo)類(lèi)以林棲型為主,隼形目,鸮形目,雀形目,雞形目等鳥(niǎo)類(lèi)為優(yōu)勢(shì)種,主要有花尾榛雞(飛龍),細(xì)嘴松雞,松雀鷹,尾林鸮等。全市野生動(dòng)物300余種,列入國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)的動(dòng)物有60余種，分布具有明顯的地帶性。原始森林常見(jiàn)有馬鹿、駝鹿、野豬、狍、灰鼠、蒼鷹、山鷹、啄木鳥(niǎo)等。次生林帶常見(jiàn)有馬鹿、駝鹿、狍、野豬、黑熊、黃鼬、伶鼬、大山雀、金翅雀、巖鷚、花尾榛雞,斑翅山鶉等。草原地帶主要有狼、狐貍、雪兔、艾虎、黃鼠、黑線姬鼠、鼢鼠、鳶鵟、紅隼等。水禽主要有赤麻鴨、綠翅鴨、骨頂雞等。魚(yú)類(lèi)資源主要有細(xì)鱗魚(yú)、羅魚(yú)、狗魚(yú)、鯉魚(yú)泥鰍、鯽魚(yú)、重唇、東北雅羅魚(yú)、魚(yú)骨子、花鰍、棒花等。

根河市地表、地下水資源豐富。境內(nèi)大小河流400余條,是額爾古納水系的重要組成部分。地下、地表水極其豐富,總量38.54億立方米,屬豐水地區(qū),而且水質(zhì)好,水量的地域分布比較均衡。地下水總量6.71億立方米,其特點(diǎn):埋藏淺、水量大、水質(zhì)好。

根河市是大興安嶺植物區(qū)的重要組成部分。大興安嶺植物區(qū)是東西伯利亞植物區(qū)系向南延伸的部分。本植物區(qū)除廣布種以外,東西伯利亞植物區(qū)系成分約占51%,加之根河市西南部是森林向草原過(guò)渡地帶,又混有相當(dāng)數(shù)量的滿(mǎn)洲植物區(qū)系成分,構(gòu)成根河市植物的多樣性和區(qū)域的獨(dú)特性。根河地區(qū)主要有維管植物、苔蘚植物和藻類(lèi)植物、真菌等。維管植物生活型組成有常綠針葉喬木、夏綠針葉喬木、常綠闊葉灌木、夏綠闊葉灌木、多年生草本。野果主要有越桔（紅豆、牙疙瘩）、篤斯越桔（篤斯、都柿、旬果、地果）、山荊子（山丁子）、稠李子等。根河市素有“天然藥庫(kù)”之稱(chēng)，有中草藥158科、380屬、696種。其中有野生藥用植物75科、366種，有利用價(jià)值的100余種。藥用植物儲(chǔ)量大、分布廣、質(zhì)量好的主要有金蓮花、地榆、白頭翁、防風(fēng)、沙參、黃芪、赤芍、元胡、玉竹、興安杜鵑、紫蘇、杜香、柴胡、越桔、百合、龍膽等。苔蘚植物有柳葉蘚科、叢蘚科、曲尾蘚科、真蘚科、灰蘚科、泥炭蘚科、提燈蘚科、青蘚科、金發(fā)蘚科等。蘚科植物均屬北溫帶地區(qū)常見(jiàn)大科，以高山寒地生長(zhǎng)為主。主要生態(tài)群落分為水生、土生、石生、木生4種類(lèi)型。藻類(lèi)植物主要有藍(lán)藻門(mén)、綠藻門(mén)、輪藻門(mén)、裸藻門(mén)、金藻門(mén)、黃藻門(mén)、硅藻門(mén)等。根河市境內(nèi)真菌有18科、58屬、114種，其中草藥用22種，毒性15種。主要食用菌有樺蘑、油蘑、木耳等。